宿城区历史悠久，据可考文字记载，已有3000多年建城史。始为远古东夷族首领少昊活动地域。春秋时为犹国、钟吾国一部分，后又相继为吴、楚国属地。秦时在此设下相县，属泗水郡。汉魏时属临淮郡、下邳郡。公元405年（东晋安帝义熙元年）于下相县东南置宿预县，治所在犹古城（今宿城区郑楼镇古黄河北岸）。南北朝时又多次撤并、复设。公元550年，废下相县，其辖地归宿预县。公元762年（唐代宗宝应元年），为避代宗李豫名讳，改宿预县为宿迁县。唐、宋、元、明、清时，境域均有变动，隶属关系也多次变更，先后属泗州郡、下邳郡、淮安府、徐州府。

　　辛亥革命时，废州府制，宿迁直属江苏省公署。1927年国民革命军北伐后，属淮阴行政督察区。抗日战争时期，中国共产党在宿迁城周边建立宿迁县、宿北县、泗宿县、睢宿县和运河特区5个县级民主政权。1945年8月，中共泗宿县委和县总队接管宿迁县城，在县城及近郊设立宿迁市。1949年5月，撤销泗宿县和宿迁县，泗宿县部分地区和宿迁市并归宿迁县，隶属淮阴地区。1983年江苏省实行市管县体制，宿迁县属淮阴市。1987年12月5日，国务院批准宿迁县改为宿迁市（县级），仍属淮阴市所辖。

　　宿城区是1996年9月伴随地级宿迁市组建而设立的行政区域。组建时辖5个乡镇；2000年5月区划调整后辖2个乡镇、4个街道。2004年3月区划调整，辖14个乡镇、4个街道和1个省级经济开发区。2013年6月区划调整，辖11个乡镇、4个街道、1个省级经济开发区和1个省级现代农业产业园；2018年3月区划调整，撤销宿城区双庄镇，设立宿城区双庄街道、支口街道，现辖10个乡镇、6个街道、1个省级经济开发区和1个省级现代农业产业园，区域总面积854平方公里。